Медицинская часть интерната осуществляет фармацевтическую деятельность. В интернате работает отлицензированная аптека, которая располагается в отдельном крыле здания медицинской части, имеет три комнаты для хранения медикаментов и изделий медицинского назначения. 

Своя аптека интерната дает возможность в короткие сроки выполнять назначения лечащих врачей. Руководит работой аптеки провизор, имеющий сертификат специалиста. Заведующий аптекой проводит занятия с лечащими врачами, знакомит их с новыми лекарствами, дает рекомендации по механизму действия препаратов, следит за их сроками реализации.

Аптека имеет двухмесячный запас медикаментов, необходимый для бесперебойного планомерного лечения клиентов.